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211
requirements.txt
211
requirements.txt
@ -1,201 +1,10 @@
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|||||||
alabaster==0.7.12
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jupyter
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anyio==3.6.2
|
spyder
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||||||
argon2-cffi==21.3.0
|
mdanalysis
|
||||||
argon2-cffi-bindings==21.2.0
|
pathos
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arrow==1.2.3
|
pandas
|
||||||
astroid==2.12.12
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dask
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atomicwrites==1.4.1
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sqlalchemy
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attrs==22.1.0
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psycopg2-binary
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autopep8==1.6.0
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ipyvlume
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Babel==2.11.0
|
jupyter_contrib_nbextensions
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backcall==0.2.0
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||||||
beautifulsoup4==4.11.1
|
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||||||
binaryornot==0.4.4
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||||||
biopython==1.79
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||||||
black==22.10.0
|
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||||||
bleach==5.0.1
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||||||
certifi==2022.9.24
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||||||
cffi==1.15.1
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||||||
chardet==5.0.0
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||||||
charset-normalizer==2.1.1
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||||||
click==8.1.3
|
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||||||
cloudpickle==2.2.0
|
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||||||
contourpy==1.0.6
|
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||||||
cookiecutter==2.1.1
|
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||||||
cryptography==38.0.3
|
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||||||
cycler==0.11.0
|
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||||||
dask==2022.10.2
|
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||||||
debugpy==1.6.3
|
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||||||
decorator==5.1.1
|
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||||||
defusedxml==0.7.1
|
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||||||
diff-match-patch==20200713
|
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||||||
dill==0.3.6
|
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||||||
docstring-to-markdown==0.10
|
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||||||
docutils==0.19
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||||||
entrypoints==0.4
|
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||||||
fasteners==0.18
|
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||||||
fastjsonschema==2.16.2
|
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||||||
flake8==5.0.4
|
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||||||
fonttools==4.38.0
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||||||
fsspec==2022.10.0
|
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||||||
greenlet==2.0.0.post0
|
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||||||
GridDataFormats==1.0.1
|
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||||||
gsd==2.6.1
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idna==3.4
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imagesize==1.4.1
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importlib-metadata==5.0.0
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||||||
inflection==0.5.1
|
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||||||
intervaltree==3.1.0
|
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||||||
ipydatawidgets==4.3.2
|
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||||||
ipykernel==6.17.0
|
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||||||
ipython==7.34.0
|
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||||||
ipython-genutils==0.2.0
|
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||||||
ipyvolume==0.5.2
|
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||||||
ipywebrtc==0.6.0
|
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||||||
ipywidgets==8.0.2
|
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||||||
isort==5.10.1
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||||||
jaraco.classes==3.2.3
|
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||||||
jedi==0.18.1
|
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||||||
jeepney==0.8.0
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||||||
jellyfish==0.9.0
|
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||||||
Jinja2==3.1.2
|
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||||||
jinja2-time==0.2.0
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||||||
joblib==1.2.0
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||||||
jsonschema==4.17.0
|
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||||||
jupyter==1.0.0
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||||||
jupyter-console==6.4.4
|
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||||||
jupyter-contrib-core==0.4.0
|
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||||||
jupyter-contrib-nbextensions==0.5.1
|
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||||||
jupyter-highlight-selected-word==0.2.0
|
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||||||
jupyter-latex-envs==1.4.6
|
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||||||
jupyter-nbextensions-configurator==0.5.0
|
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||||||
jupyter-server==1.21.0
|
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||||||
jupyter_client==7.4.4
|
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||||||
jupyter_core==4.11.2
|
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||||||
jupyterlab-pygments==0.2.2
|
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||||||
jupyterlab-widgets==3.0.3
|
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||||||
keyring==23.11.0
|
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||||||
kiwisolver==1.4.4
|
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||||||
lazy-object-proxy==1.8.0
|
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||||||
locket==1.0.0
|
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||||||
lxml==4.9.1
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||||||
MarkupSafe==2.1.1
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matplotlib==3.6.2
|
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||||||
matplotlib-inline==0.1.6
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||||||
mccabe==0.7.0
|
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||||||
MDAnalysis==2.3.0
|
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||||||
mistune==2.0.4
|
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||||||
mmtf-python==1.1.3
|
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||||||
more-itertools==9.0.0
|
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||||||
mrcfile==1.4.3
|
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||||||
msgpack==1.0.4
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||||||
multiprocess==0.70.14
|
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||||||
mypy-extensions==0.4.3
|
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||||||
nbclassic==0.4.8
|
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||||||
nbclient==0.7.0
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||||||
nbconvert==7.2.3
|
|
||||||
nbformat==5.7.0
|
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||||||
nest-asyncio==1.5.6
|
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||||||
networkx==2.8.8
|
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||||||
notebook==6.5.2
|
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||||||
notebook_shim==0.2.2
|
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||||||
numpy==1.23.4
|
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||||||
numpydoc==1.5.0
|
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||||||
packaging==21.3
|
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||||||
pandas==1.5.1
|
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||||||
pandocfilters==1.5.0
|
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||||||
parso==0.8.3
|
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||||||
partd==1.3.0
|
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||||||
pathos==0.3.0
|
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||||||
pathspec==0.10.1
|
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||||||
pexpect==4.8.0
|
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||||||
pickleshare==0.7.5
|
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||||||
Pillow==9.3.0
|
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||||||
platformdirs==2.5.2
|
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||||||
pluggy==1.0.0
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||||||
pox==0.3.2
|
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||||||
ppft==1.7.6.6
|
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||||||
prometheus-client==0.15.0
|
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||||||
prompt-toolkit==3.0.32
|
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||||||
psutil==5.9.3
|
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||||||
psycopg2-binary==2.9.5
|
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||||||
ptyprocess==0.7.0
|
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||||||
pycodestyle==2.9.1
|
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||||||
pycparser==2.21
|
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||||||
pydocstyle==6.1.1
|
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||||||
pyflakes==2.5.0
|
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||||||
Pygments==2.13.0
|
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||||||
pylint==2.15.5
|
|
||||||
pylint-venv==2.3.0
|
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||||||
pyls-spyder==0.4.0
|
|
||||||
pyparsing==3.0.9
|
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||||||
PyQt5==5.15.7
|
|
||||||
PyQt5-Qt5==5.15.2
|
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||||||
PyQt5-sip==12.11.0
|
|
||||||
PyQtWebEngine==5.15.6
|
|
||||||
PyQtWebEngine-Qt5==5.15.2
|
|
||||||
pyrsistent==0.19.2
|
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||||||
python-dateutil==2.8.2
|
|
||||||
python-lsp-black==1.2.1
|
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||||||
python-lsp-jsonrpc==1.0.0
|
|
||||||
python-lsp-server==1.6.0
|
|
||||||
python-slugify==6.1.2
|
|
||||||
pythreejs==2.4.1
|
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||||||
pytoolconfig==1.2.2
|
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||||||
pytz==2022.6
|
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||||||
pyxdg==0.28
|
|
||||||
PyYAML==6.0
|
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||||||
pyzmq==24.0.1
|
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||||||
QDarkStyle==3.0.3
|
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||||||
qstylizer==0.2.2
|
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||||||
QtAwesome==1.2.1
|
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||||||
qtconsole==5.4.0
|
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||||||
QtPy==2.2.1
|
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||||||
requests==2.28.1
|
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||||||
rope==1.4.0
|
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||||||
Rtree==1.0.1
|
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||||||
scipy==1.9.3
|
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||||||
SecretStorage==3.3.3
|
|
||||||
Send2Trash==1.8.0
|
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||||||
six==1.16.0
|
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||||||
sniffio==1.3.0
|
|
||||||
snowballstemmer==2.2.0
|
|
||||||
sortedcontainers==2.4.0
|
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||||||
soupsieve==2.3.2.post1
|
|
||||||
Sphinx==5.3.0
|
|
||||||
sphinxcontrib-applehelp==1.0.2
|
|
||||||
sphinxcontrib-devhelp==1.0.2
|
|
||||||
sphinxcontrib-htmlhelp==2.0.0
|
|
||||||
sphinxcontrib-jsmath==1.0.1
|
|
||||||
sphinxcontrib-qthelp==1.0.3
|
|
||||||
sphinxcontrib-serializinghtml==1.1.5
|
|
||||||
spyder==5.4.0
|
|
||||||
spyder-kernels==2.4.0
|
|
||||||
SQLAlchemy==1.4.43
|
|
||||||
terminado==0.17.0
|
|
||||||
text-unidecode==1.3
|
|
||||||
textdistance==4.5.0
|
|
||||||
threadpoolctl==3.1.0
|
|
||||||
three-merge==0.1.1
|
|
||||||
tinycss2==1.2.1
|
|
||||||
toml==0.10.2
|
|
||||||
tomli==2.0.1
|
|
||||||
tomlkit==0.11.6
|
|
||||||
toolz==0.12.0
|
|
||||||
tornado==6.2
|
|
||||||
tqdm==4.64.1
|
|
||||||
traitlets==5.5.0
|
|
||||||
traittypes==0.2.1
|
|
||||||
typing_extensions==4.4.0
|
|
||||||
ujson==5.5.0
|
|
||||||
urllib3==1.26.12
|
|
||||||
watchdog==2.1.9
|
|
||||||
wcwidth==0.2.5
|
|
||||||
webencodings==0.5.1
|
|
||||||
websocket-client==1.4.2
|
|
||||||
whatthepatch==1.0.2
|
|
||||||
widgetsnbextension==4.0.3
|
|
||||||
wrapt==1.14.1
|
|
||||||
wurlitzer==3.0.2
|
|
||||||
yapf==0.32.0
|
|
||||||
zipp==3.10.0
|
|
||||||
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