Calculate Relaxation mit LogGauss #119

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2023-09-12T06:31:49Z

saeckech commented

2023-09-12 06:31:49 +00:00

Huhu!
Ich versuche immernoch mittels zwei Datensets (tau, sigma) die zugehörigen T1 bei gegebener Frequenz ausrechnen zu lassen. Ich habe die neueste Version des Auswerteprogramms heute Morgen heruntergeladen, die Fehlermeldung von gestern wurde dort durch eine andere abgelöst:

12/09/2023 08:27:18 - ERROR - root : Uncaught exception:
Traceback (most recent call last):
File "/tmp/.mount_NMRevaP56uBj/usr/src/gui_qt/main/management.py", line 1195, in calc_relaxation
y[i] = relax_func(x2, _x[i])
File "/tmp/.mount_NMRevaP56uBj/usr/src/nmreval/nmr/relaxation.py", line 108, in t1
return self.t1_bpp(omega, tau, *specdens_args, kwargs)
File "/tmp/.mount_NMRevaP56uBj/usr/src/nmreval/nmr/relaxation.py", line 196, in t1_bpp
rate = prefactor * (self.distribution.specdens(omega, tau, *specdens_args) +
File "/tmp/.mount_NMRevaP56uBj/usr/src/nmreval/distributions/loggaussian.py", line 72, in specdens
ret_val[_omega == 0, :] = tau[None, :] * np.exp(sigma2 / 2)
IndexError: invalid index to scalar variable.

Huhu! Ich versuche immernoch mittels zwei Datensets (tau, sigma) die zugehörigen T1 bei gegebener Frequenz ausrechnen zu lassen. Ich habe die neueste Version des Auswerteprogramms heute Morgen heruntergeladen, die Fehlermeldung von gestern wurde dort durch eine andere abgelöst: 12/09/2023 08:27:18 - ERROR - root : Uncaught exception: Traceback (most recent call last): File "/tmp/.mount_NMRevaP56uBj/usr/src/gui_qt/main/management.py", line 1195, in calc_relaxation y[i] = relax_func(x2, _x[i]) File "/tmp/.mount_NMRevaP56uBj/usr/src/nmreval/nmr/relaxation.py", line 108, in t1 return self.t1_bpp(omega, tau, *specdens_args, **kwargs) File "/tmp/.mount_NMRevaP56uBj/usr/src/nmreval/nmr/relaxation.py", line 196, in t1_bpp rate = prefactor * (self.distribution.specdens(omega, tau, *specdens_args) + File "/tmp/.mount_NMRevaP56uBj/usr/src/nmreval/distributions/loggaussian.py", line 72, in specdens ret_val[_omega == 0, :] = tau[None, :] * np.exp(sigma**2 / 2) IndexError: invalid index to scalar variable.

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2023-09-12 07:07:38 +00:00

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2023-09-12 07:07:38 +00:00

saeckech commented

2023-09-12 08:55:00 +00:00

Berechnung mit Datensets zu fit-tau und sigma scheint jetzt zu klappen, danke :)

Interpretation as: Arithmetic mean: scheint aber sigma ein weiteres Mal zu verarbeiten. Zumindest reagiert T1 auf die für sigma eingestellten Werte.

Berechnung mit Datensets zu fit-tau und sigma scheint jetzt zu klappen, danke :) Interpretation as: Arithmetic mean: <tau> scheint aber sigma ein weiteres Mal zu verarbeiten. Zumindest reagiert T1 auf die für sigma eingestellten Werte.

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2023-09-12 08:55:00 +00:00

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dominik added the

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Type/NMR labels 2023-09-12 16:14:20 +00:00

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2023-09-12 16:16:48 +00:00

Interpretation as: Arithmetic mean: scheint aber sigma ein weiteres Mal zu verarbeiten. Zumindest reagiert T1 auf die für sigma eingestellten Werte.

Es kann sein, dass das vielleicht so sein soll: Wenn ausgewählt wird, wird der verwendete Wert von mit dem angegebenen sigma in das tau umgerechnet, das in der spektralen Dichte als Funktionswert verwendet wird. sigma kommt also tatsächlich an zwei Stellen in der Berechnung vor.

Wenn es aber was anderes ist, was du beobachtest, brauche ich vermutlich mehr Infos zu dem, was passiert

> Interpretation as: Arithmetic mean: <tau> scheint aber sigma ein weiteres Mal zu verarbeiten. Zumindest reagiert T1 auf die für sigma eingestellten Werte. Es kann sein, dass das vielleicht so sein soll: Wenn <tau> ausgewählt wird, wird der verwendete Wert von <tau> mit dem angegebenen sigma in das tau umgerechnet, das in der spektralen Dichte als Funktionswert verwendet wird. sigma kommt also tatsächlich an zwei Stellen in der Berechnung vor. Wenn es aber was anderes ist, was du beobachtest, brauche ich vermutlich mehr Infos zu dem, was passiert

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2023-09-13 15:47:19 +00:00

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